Protein–RNA interactions for Protein: O75688

PPM1B, Protein phosphatase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPM1BO75688 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PPM1BO75688 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1BO75688 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1BO75688 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PPM1BO75688 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1BO75688 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PPM1BO75688 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1BO75688 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PPM1BO75688 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PPM1BO75688 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PPM1BO75688 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1BO75688 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1BO75688 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1BO75688 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1BO75688 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PPM1BO75688 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1BO75688 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PPM1BO75688 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1BO75688 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PPM1BO75688 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPM1BO75688 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPM1BO75688 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPM1BO75688 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1BO75688 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPM1BO75688 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1BO75688 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1BO75688 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPM1BO75688 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPM1BO75688 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPM1BO75688 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPM1BO75688 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPM1BO75688 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1BO75688 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1BO75688 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPM1BO75688 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPM1BO75688 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1BO75688 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPM1BO75688 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPM1BO75688 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPM1BO75688 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPM1BO75688 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1BO75688 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPM1BO75688 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPM1BO75688 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1BO75688 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPM1BO75688 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1BO75688 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1BO75688 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPM1BO75688 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPM1BO75688 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPM1BO75688 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms