Protein–RNA interactions for Protein: O75410

TACC1, Transforming acidic coiled-coil-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACC1O75410 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TACC1O75410 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
TACC1O75410 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TACC1O75410 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TACC1O75410 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TACC1O75410 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TACC1O75410 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TACC1O75410 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TACC1O75410 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TACC1O75410 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TACC1O75410 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TACC1O75410 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TACC1O75410 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TACC1O75410 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TACC1O75410 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TACC1O75410 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TACC1O75410 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TACC1O75410 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TACC1O75410 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TACC1O75410 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TACC1O75410 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TACC1O75410 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TACC1O75410 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TACC1O75410 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TACC1O75410 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TACC1O75410 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TACC1O75410 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TACC1O75410 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TACC1O75410 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TACC1O75410 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TACC1O75410 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TACC1O75410 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TACC1O75410 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TACC1O75410 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TACC1O75410 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TACC1O75410 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TACC1O75410 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TACC1O75410 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TACC1O75410 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TACC1O75410 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TACC1O75410 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TACC1O75410 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TACC1O75410 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TACC1O75410 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TACC1O75410 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TACC1O75410 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TACC1O75410 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TACC1O75410 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TACC1O75410 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TACC1O75410 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TACC1O75410 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TACC1O75410 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TACC1O75410 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TACC1O75410 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TACC1O75410 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TACC1O75410 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TACC1O75410 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TACC1O75410 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TACC1O75410 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
TACC1O75410 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TACC1O75410 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TACC1O75410 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TACC1O75410 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TACC1O75410 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TACC1O75410 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TACC1O75410 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TACC1O75410 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TACC1O75410 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TACC1O75410 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TACC1O75410 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TACC1O75410 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TACC1O75410 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TACC1O75410 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TACC1O75410 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TACC1O75410 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TACC1O75410 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TACC1O75410 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TACC1O75410 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TACC1O75410 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TACC1O75410 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TACC1O75410 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TACC1O75410 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TACC1O75410 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TACC1O75410 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TACC1O75410 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TACC1O75410 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TACC1O75410 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TACC1O75410 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TACC1O75410 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TACC1O75410 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TACC1O75410 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TACC1O75410 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TACC1O75410 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TACC1O75410 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TACC1O75410 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TACC1O75410 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TACC1O75410 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TACC1O75410 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TACC1O75410 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TACC1O75410 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms