Protein–RNA interactions for Protein: O60383

GDF9, Growth/differentiation factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF9O60383 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GDF9O60383 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDF9O60383 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDF9O60383 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDF9O60383 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF9O60383 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDF9O60383 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GDF9O60383 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GDF9O60383 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDF9O60383 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF9O60383 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GDF9O60383 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GDF9O60383 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GDF9O60383 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GDF9O60383 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GDF9O60383 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GDF9O60383 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GDF9O60383 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GDF9O60383 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDF9O60383 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDF9O60383 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDF9O60383 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDF9O60383 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDF9O60383 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDF9O60383 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDF9O60383 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GDF9O60383 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GDF9O60383 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDF9O60383 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDF9O60383 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDF9O60383 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDF9O60383 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDF9O60383 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF9O60383 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDF9O60383 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDF9O60383 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDF9O60383 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GDF9O60383 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDF9O60383 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDF9O60383 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF9O60383 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF9O60383 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDF9O60383 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDF9O60383 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDF9O60383 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDF9O60383 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF9O60383 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF9O60383 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF9O60383 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDF9O60383 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GDF9O60383 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF9O60383 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDF9O60383 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF9O60383 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDF9O60383 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDF9O60383 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
GDF9O60383 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GDF9O60383 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
GDF9O60383 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GDF9O60383 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GDF9O60383 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GDF9O60383 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GDF9O60383 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GDF9O60383 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GDF9O60383 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GDF9O60383 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GDF9O60383 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF9O60383 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF9O60383 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GDF9O60383 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF9O60383 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GDF9O60383 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF9O60383 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF9O60383 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GDF9O60383 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF9O60383 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF9O60383 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GDF9O60383 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDF9O60383 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GDF9O60383 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF9O60383 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GDF9O60383 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GDF9O60383 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDF9O60383 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDF9O60383 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GDF9O60383 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GDF9O60383 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GDF9O60383 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GDF9O60383 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF9O60383 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GDF9O60383 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GDF9O60383 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GDF9O60383 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF9O60383 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF9O60383 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GDF9O60383 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF9O60383 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GDF9O60383 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GDF9O60383 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GDF9O60383 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms