Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BNIP3LO60238 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BNIP3LO60238 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BNIP3LO60238 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BNIP3LO60238 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BNIP3LO60238 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BNIP3LO60238 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BNIP3LO60238 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BNIP3LO60238 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BNIP3LO60238 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BNIP3LO60238 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BNIP3LO60238 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BNIP3LO60238 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BNIP3LO60238 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BNIP3LO60238 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BNIP3LO60238 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BNIP3LO60238 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BNIP3LO60238 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BNIP3LO60238 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BNIP3LO60238 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BNIP3LO60238 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BNIP3LO60238 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BNIP3LO60238 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BNIP3LO60238 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BNIP3LO60238 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BNIP3LO60238 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BNIP3LO60238 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BNIP3LO60238 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BNIP3LO60238 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BNIP3LO60238 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BNIP3LO60238 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BNIP3LO60238 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BNIP3LO60238 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BNIP3LO60238 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BNIP3LO60238 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BNIP3LO60238 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BNIP3LO60238 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BNIP3LO60238 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BNIP3LO60238 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BNIP3LO60238 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BNIP3LO60238 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BNIP3LO60238 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BNIP3LO60238 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BNIP3LO60238 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BNIP3LO60238 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BNIP3LO60238 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BNIP3LO60238 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BNIP3LO60238 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BNIP3LO60238 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BNIP3LO60238 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BNIP3LO60238 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BNIP3LO60238 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BNIP3LO60238 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BNIP3LO60238 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BNIP3LO60238 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BNIP3LO60238 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BNIP3LO60238 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BNIP3LO60238 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BNIP3LO60238 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BNIP3LO60238 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BNIP3LO60238 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BNIP3LO60238 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BNIP3LO60238 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BNIP3LO60238 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BNIP3LO60238 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BNIP3LO60238 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BNIP3LO60238 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BNIP3LO60238 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BNIP3LO60238 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BNIP3LO60238 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BNIP3LO60238 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BNIP3LO60238 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BNIP3LO60238 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BNIP3LO60238 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BNIP3LO60238 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BNIP3LO60238 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BNIP3LO60238 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BNIP3LO60238 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BNIP3LO60238 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
BNIP3LO60238 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BNIP3LO60238 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BNIP3LO60238 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BNIP3LO60238 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BNIP3LO60238 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BNIP3LO60238 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BNIP3LO60238 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BNIP3LO60238 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BNIP3LO60238 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BNIP3LO60238 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms