Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AP1G1O43747 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
AP1G1O43747 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP1G1O43747 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP1G1O43747 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AP1G1O43747 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AP1G1O43747 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
AP1G1O43747 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AP1G1O43747 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AP1G1O43747 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AP1G1O43747 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP1G1O43747 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AP1G1O43747 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AP1G1O43747 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AP1G1O43747 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AP1G1O43747 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AP1G1O43747 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AP1G1O43747 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
AP1G1O43747 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AP1G1O43747 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AP1G1O43747 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
AP1G1O43747 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP1G1O43747 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP1G1O43747 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AP1G1O43747 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP1G1O43747 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP1G1O43747 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AP1G1O43747 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP1G1O43747 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP1G1O43747 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
AP1G1O43747 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP1G1O43747 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AP1G1O43747 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AP1G1O43747 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
AP1G1O43747 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
AP1G1O43747 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP1G1O43747 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP1G1O43747 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP1G1O43747 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP1G1O43747 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP1G1O43747 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP1G1O43747 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AP1G1O43747 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AP1G1O43747 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AP1G1O43747 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
AP1G1O43747 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
AP1G1O43747 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AP1G1O43747 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP1G1O43747 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
AP1G1O43747 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP1G1O43747 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
AP1G1O43747 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
AP1G1O43747 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AP1G1O43747 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP1G1O43747 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms