Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SEMA3EO15041 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SEMA3EO15041 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SEMA3EO15041 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SEMA3EO15041 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SEMA3EO15041 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SEMA3EO15041 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SEMA3EO15041 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SEMA3EO15041 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
SEMA3EO15041 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SEMA3EO15041 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SEMA3EO15041 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SEMA3EO15041 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SEMA3EO15041 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SEMA3EO15041 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SEMA3EO15041 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SEMA3EO15041 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SEMA3EO15041 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SEMA3EO15041 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SEMA3EO15041 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SEMA3EO15041 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SEMA3EO15041 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SEMA3EO15041 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
SEMA3EO15041 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SEMA3EO15041 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SEMA3EO15041 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SEMA3EO15041 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SEMA3EO15041 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SEMA3EO15041 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SEMA3EO15041 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SEMA3EO15041 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SEMA3EO15041 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SEMA3EO15041 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SEMA3EO15041 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SEMA3EO15041 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SEMA3EO15041 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SEMA3EO15041 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SEMA3EO15041 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SEMA3EO15041 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SEMA3EO15041 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SEMA3EO15041 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SEMA3EO15041 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SEMA3EO15041 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SEMA3EO15041 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SEMA3EO15041 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SEMA3EO15041 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
SEMA3EO15041 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
SEMA3EO15041 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SEMA3EO15041 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SEMA3EO15041 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
SEMA3EO15041 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SEMA3EO15041 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SEMA3EO15041 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SEMA3EO15041 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SEMA3EO15041 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SEMA3EO15041 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SEMA3EO15041 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SEMA3EO15041 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SEMA3EO15041 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SEMA3EO15041 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SEMA3EO15041 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
SEMA3EO15041 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SEMA3EO15041 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SEMA3EO15041 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SEMA3EO15041 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SEMA3EO15041 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SEMA3EO15041 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SEMA3EO15041 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SEMA3EO15041 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SEMA3EO15041 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SEMA3EO15041 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms