Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RIMBP2O15034 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RIMBP2O15034 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RIMBP2O15034 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RIMBP2O15034 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RIMBP2O15034 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RIMBP2O15034 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RIMBP2O15034 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RIMBP2O15034 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RIMBP2O15034 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RIMBP2O15034 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
RIMBP2O15034 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RIMBP2O15034 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RIMBP2O15034 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RIMBP2O15034 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RIMBP2O15034 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RIMBP2O15034 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RIMBP2O15034 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RIMBP2O15034 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RIMBP2O15034 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RIMBP2O15034 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RIMBP2O15034 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RIMBP2O15034 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RIMBP2O15034 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RIMBP2O15034 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RIMBP2O15034 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
RIMBP2O15034 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RIMBP2O15034 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RIMBP2O15034 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RIMBP2O15034 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RIMBP2O15034 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RIMBP2O15034 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMBP2O15034 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RIMBP2O15034 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
RIMBP2O15034 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RIMBP2O15034 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RIMBP2O15034 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34■■■■□ 3.03
RIMBP2O15034 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RIMBP2O15034 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP2O15034 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP2O15034 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP2O15034 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMBP2O15034 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMBP2O15034 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMBP2O15034 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMBP2O15034 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMBP2O15034 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMBP2O15034 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RIMBP2O15034 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP2O15034 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP2O15034 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RIMBP2O15034 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RIMBP2O15034 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMBP2O15034 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RIMBP2O15034 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RIMBP2O15034 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMBP2O15034 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RIMBP2O15034 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RIMBP2O15034 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RIMBP2O15034 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.82■■■■□ 3
RIMBP2O15034 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RIMBP2O15034 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RIMBP2O15034 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
RIMBP2O15034 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RIMBP2O15034 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
RIMBP2O15034 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
RIMBP2O15034 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RIMBP2O15034 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RIMBP2O15034 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RIMBP2O15034 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RIMBP2O15034 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RIMBP2O15034 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
RIMBP2O15034 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
RIMBP2O15034 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIMBP2O15034 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RIMBP2O15034 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms