Protein–RNA interactions for Protein: O14939

PLD2, Phospholipase D2, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD2O14939 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLD2O14939 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLD2O14939 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLD2O14939 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLD2O14939 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLD2O14939 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLD2O14939 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLD2O14939 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLD2O14939 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLD2O14939 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLD2O14939 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLD2O14939 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLD2O14939 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PLD2O14939 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLD2O14939 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLD2O14939 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLD2O14939 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PLD2O14939 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PLD2O14939 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLD2O14939 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PLD2O14939 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PLD2O14939 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLD2O14939 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLD2O14939 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLD2O14939 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLD2O14939 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLD2O14939 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLD2O14939 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLD2O14939 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLD2O14939 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLD2O14939 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLD2O14939 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLD2O14939 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PLD2O14939 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLD2O14939 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLD2O14939 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLD2O14939 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLD2O14939 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLD2O14939 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLD2O14939 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLD2O14939 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLD2O14939 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLD2O14939 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLD2O14939 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLD2O14939 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLD2O14939 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLD2O14939 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLD2O14939 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLD2O14939 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLD2O14939 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLD2O14939 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PLD2O14939 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLD2O14939 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLD2O14939 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLD2O14939 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLD2O14939 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLD2O14939 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLD2O14939 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLD2O14939 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLD2O14939 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLD2O14939 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PLD2O14939 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLD2O14939 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLD2O14939 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLD2O14939 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLD2O14939 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLD2O14939 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLD2O14939 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLD2O14939 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLD2O14939 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLD2O14939 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLD2O14939 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLD2O14939 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PLD2O14939 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLD2O14939 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PLD2O14939 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLD2O14939 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PLD2O14939 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PLD2O14939 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLD2O14939 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLD2O14939 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLD2O14939 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLD2O14939 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLD2O14939 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PLD2O14939 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PLD2O14939 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLD2O14939 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLD2O14939 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLD2O14939 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PLD2O14939 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PLD2O14939 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PLD2O14939 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLD2O14939 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PLD2O14939 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLD2O14939 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PLD2O14939 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PLD2O14939 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLD2O14939 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PLD2O14939 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PLD2O14939 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms