Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BCKDKO14874 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BCKDKO14874 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BCKDKO14874 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BCKDKO14874 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BCKDKO14874 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCKDKO14874 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BCKDKO14874 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCKDKO14874 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BCKDKO14874 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCKDKO14874 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCKDKO14874 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BCKDKO14874 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BCKDKO14874 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCKDKO14874 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BCKDKO14874 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCKDKO14874 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCKDKO14874 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BCKDKO14874 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BCKDKO14874 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCKDKO14874 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BCKDKO14874 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BCKDKO14874 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BCKDKO14874 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BCKDKO14874 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCKDKO14874 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BCKDKO14874 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCKDKO14874 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BCKDKO14874 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BCKDKO14874 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCKDKO14874 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BCKDKO14874 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCKDKO14874 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCKDKO14874 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BCKDKO14874 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCKDKO14874 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCKDKO14874 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BCKDKO14874 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BCKDKO14874 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BCKDKO14874 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BCKDKO14874 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BCKDKO14874 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BCKDKO14874 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BCKDKO14874 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BCKDKO14874 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BCKDKO14874 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BCKDKO14874 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCKDKO14874 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCKDKO14874 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BCKDKO14874 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BCKDKO14874 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCKDKO14874 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BCKDKO14874 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BCKDKO14874 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms