Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BCKDKO14874 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BCKDKO14874 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BCKDKO14874 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
BCKDKO14874 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
BCKDKO14874 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCKDKO14874 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
BCKDKO14874 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
BCKDKO14874 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
BCKDKO14874 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
BCKDKO14874 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BCKDKO14874 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
BCKDKO14874 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCKDKO14874 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCKDKO14874 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
BCKDKO14874 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
BCKDKO14874 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BCKDKO14874 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCKDKO14874 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCKDKO14874 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCKDKO14874 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCKDKO14874 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCKDKO14874 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCKDKO14874 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BCKDKO14874 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BCKDKO14874 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BCKDKO14874 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BCKDKO14874 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BCKDKO14874 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BCKDKO14874 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BCKDKO14874 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BCKDKO14874 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BCKDKO14874 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCKDKO14874 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCKDKO14874 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCKDKO14874 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCKDKO14874 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCKDKO14874 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCKDKO14874 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCKDKO14874 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BCKDKO14874 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BCKDKO14874 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BCKDKO14874 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BCKDKO14874 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BCKDKO14874 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCKDKO14874 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BCKDKO14874 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BCKDKO14874 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCKDKO14874 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BCKDKO14874 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BCKDKO14874 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BCKDKO14874 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BCKDKO14874 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCKDKO14874 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCKDKO14874 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BCKDKO14874 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BCKDKO14874 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCKDKO14874 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCKDKO14874 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCKDKO14874 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCKDKO14874 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCKDKO14874 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BCKDKO14874 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCKDKO14874 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BCKDKO14874 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BCKDKO14874 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCKDKO14874 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BCKDKO14874 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BCKDKO14874 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCKDKO14874 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCKDKO14874 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCKDKO14874 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BCKDKO14874 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCKDKO14874 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BCKDKO14874 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BCKDKO14874 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BCKDKO14874 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCKDKO14874 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BCKDKO14874 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BCKDKO14874 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCKDKO14874 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BCKDKO14874 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCKDKO14874 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BCKDKO14874 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BCKDKO14874 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCKDKO14874 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BCKDKO14874 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCKDKO14874 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCKDKO14874 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BCKDKO14874 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BCKDKO14874 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BCKDKO14874 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BCKDKO14874 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BCKDKO14874 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BCKDKO14874 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BCKDKO14874 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BCKDKO14874 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BCKDKO14874 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BCKDKO14874 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BCKDKO14874 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms