Protein–RNA interactions for Protein: O14718

RRH, Visual pigment-like receptor peropsin, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRHO14718 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RRHO14718 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRHO14718 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RRHO14718 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRHO14718 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRHO14718 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RRHO14718 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRHO14718 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RRHO14718 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRHO14718 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRHO14718 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRHO14718 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRHO14718 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRHO14718 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRHO14718 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RRHO14718 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRHO14718 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RRHO14718 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RRHO14718 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRHO14718 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRHO14718 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRHO14718 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RRHO14718 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RRHO14718 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRHO14718 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RRHO14718 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRHO14718 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RRHO14718 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRHO14718 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRHO14718 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRHO14718 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRHO14718 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRHO14718 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRHO14718 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRHO14718 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRHO14718 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRHO14718 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RRHO14718 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRHO14718 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRHO14718 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RRHO14718 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RRHO14718 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRHO14718 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RRHO14718 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRHO14718 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRHO14718 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRHO14718 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRHO14718 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRHO14718 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RRHO14718 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRHO14718 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RRHO14718 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRHO14718 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRHO14718 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRHO14718 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRHO14718 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRHO14718 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRHO14718 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRHO14718 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRHO14718 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RRHO14718 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RRHO14718 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRHO14718 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRHO14718 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RRHO14718 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRHO14718 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRHO14718 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RRHO14718 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRHO14718 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRHO14718 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRHO14718 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRHO14718 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRHO14718 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRHO14718 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRHO14718 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRHO14718 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRHO14718 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRHO14718 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRHO14718 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRHO14718 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRHO14718 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRHO14718 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRHO14718 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRHO14718 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRHO14718 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRHO14718 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRHO14718 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRHO14718 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRHO14718 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRHO14718 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRHO14718 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRHO14718 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RRHO14718 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRHO14718 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRHO14718 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRHO14718 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRHO14718 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRHO14718 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRHO14718 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRHO14718 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 522.2 ms