Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
O00370 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
O00370 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
O00370 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
O00370 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
O00370 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
O00370 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
O00370 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
O00370 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
O00370 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
O00370 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
O00370 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
O00370 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
O00370 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
O00370 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
O00370 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
O00370 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
O00370 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
O00370 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
O00370 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
O00370 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
O00370 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
O00370 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
O00370 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
O00370 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
O00370 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
O00370 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
O00370 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
O00370 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
O00370 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
O00370 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
O00370 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
O00370 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
O00370 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
O00370 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
O00370 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
O00370 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
O00370 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
O00370 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
O00370 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
O00370 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
O00370 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
O00370 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
O00370 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
O00370 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
O00370 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
O00370 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
O00370 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
O00370 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
O00370 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
O00370 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
O00370 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
O00370 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
O00370 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
O00370 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
O00370 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
O00370 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
O00370 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
O00370 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
O00370 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
O00370 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
O00370 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
O00370 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
O00370 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
O00370 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
O00370 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
O00370 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
O00370 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
O00370 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
O00370 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
O00370 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
O00370 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
O00370 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
O00370 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
O00370 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
O00370 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
O00370 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
O00370 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
O00370 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
O00370 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
O00370 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
O00370 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
O00370 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
O00370 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
O00370 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
O00370 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
O00370 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
O00370 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
O00370 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
O00370 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
O00370 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
O00370 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
O00370 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
O00370 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
O00370 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
O00370 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
O00370 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
O00370 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
O00370 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
O00370 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms