Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01387J3KSC0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LINC01387J3KSC0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LINC01387J3KSC0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LINC01387J3KSC0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LINC01387J3KSC0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LINC01387J3KSC0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01387J3KSC0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01387J3KSC0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LINC01387J3KSC0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01387J3KSC0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LINC01387J3KSC0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC01387J3KSC0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LINC01387J3KSC0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LINC01387J3KSC0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01387J3KSC0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC01387J3KSC0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01387J3KSC0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC01387J3KSC0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC01387J3KSC0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC01387J3KSC0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01387J3KSC0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01387J3KSC0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC01387J3KSC0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01387J3KSC0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01387J3KSC0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC01387J3KSC0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC01387J3KSC0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC01387J3KSC0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LINC01387J3KSC0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01387J3KSC0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01387J3KSC0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LINC01387J3KSC0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01387J3KSC0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01387J3KSC0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LINC01387J3KSC0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms