Protein–RNA interactions for Protein: A6NN73

GOLGA8CP, Golgin subfamily A member 8C, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8CPA6NN73 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA8CPA6NN73 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA8CPA6NN73 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA8CPA6NN73 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA8CPA6NN73 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GOLGA8CPA6NN73 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GOLGA8CPA6NN73 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GOLGA8CPA6NN73 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GOLGA8CPA6NN73 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA8CPA6NN73 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA8CPA6NN73 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA8CPA6NN73 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
GOLGA8CPA6NN73 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GOLGA8CPA6NN73 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GOLGA8CPA6NN73 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GOLGA8CPA6NN73 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GOLGA8CPA6NN73 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA8CPA6NN73 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GOLGA8CPA6NN73 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GOLGA8CPA6NN73 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA8CPA6NN73 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GOLGA8CPA6NN73 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GOLGA8CPA6NN73 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA8CPA6NN73 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA8CPA6NN73 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GOLGA8CPA6NN73 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GOLGA8CPA6NN73 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA8CPA6NN73 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA8CPA6NN73 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA8CPA6NN73 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA8CPA6NN73 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GOLGA8CPA6NN73 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GOLGA8CPA6NN73 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA8CPA6NN73 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA8CPA6NN73 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GOLGA8CPA6NN73 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GOLGA8CPA6NN73 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA8CPA6NN73 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GOLGA8CPA6NN73 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GOLGA8CPA6NN73 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GOLGA8CPA6NN73 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA8CPA6NN73 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GOLGA8CPA6NN73 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA8CPA6NN73 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA8CPA6NN73 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA8CPA6NN73 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GOLGA8CPA6NN73 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GOLGA8CPA6NN73 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA8CPA6NN73 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA8CPA6NN73 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GOLGA8CPA6NN73 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GOLGA8CPA6NN73 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA8CPA6NN73 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GOLGA8CPA6NN73 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA8CPA6NN73 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA8CPA6NN73 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GOLGA8CPA6NN73 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA8CPA6NN73 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GOLGA8CPA6NN73 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GOLGA8CPA6NN73 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GOLGA8CPA6NN73 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA8CPA6NN73 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GOLGA8CPA6NN73 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.57■■■□□ 2
GOLGA8CPA6NN73 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA8CPA6NN73 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
GOLGA8CPA6NN73 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA8CPA6NN73 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GOLGA8CPA6NN73 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GOLGA8CPA6NN73 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GOLGA8CPA6NN73 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GOLGA8CPA6NN73 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA8CPA6NN73 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA8CPA6NN73 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA8CPA6NN73 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GOLGA8CPA6NN73 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms