Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1B0GTW7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1B0GTW7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A1B0GTW7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A1B0GTW7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A1B0GTW7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A1B0GTW7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1B0GTW7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms