Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
A0A1B0GTW7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
A0A1B0GTW7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
A0A1B0GTW7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
A0A1B0GTW7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
A0A1B0GTW7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
A0A1B0GTW7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A1B0GTW7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
A0A1B0GTW7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A1B0GTW7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
A0A1B0GTW7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
A0A1B0GTW7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A0A1B0GTW7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A1B0GTW7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1B0GTW7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1B0GTW7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
A0A1B0GTW7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
A0A1B0GTW7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms