Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS06

TRBV23-1, T-cell receptor beta variable 23-1 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRBV23-1A0A0A0MS06 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV23-1A0A0A0MS06 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRBV23-1A0A0A0MS06 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV23-1A0A0A0MS06 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRBV23-1A0A0A0MS06 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRBV23-1A0A0A0MS06 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRBV23-1A0A0A0MS06 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV23-1A0A0A0MS06 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRBV23-1A0A0A0MS06 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRBV23-1A0A0A0MS06 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV23-1A0A0A0MS06 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRBV23-1A0A0A0MS06 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV23-1A0A0A0MS06 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV23-1A0A0A0MS06 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV23-1A0A0A0MS06 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV23-1A0A0A0MS06 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV23-1A0A0A0MS06 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV23-1A0A0A0MS06 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV23-1A0A0A0MS06 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRBV23-1A0A0A0MS06 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV23-1A0A0A0MS06 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRBV23-1A0A0A0MS06 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRBV23-1A0A0A0MS06 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV23-1A0A0A0MS06 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV23-1A0A0A0MS06 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV23-1A0A0A0MS06 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRBV23-1A0A0A0MS06 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRBV23-1A0A0A0MS06 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV23-1A0A0A0MS06 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRBV23-1A0A0A0MS06 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRBV23-1A0A0A0MS06 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV23-1A0A0A0MS06 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV23-1A0A0A0MS06 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV23-1A0A0A0MS06 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV23-1A0A0A0MS06 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV23-1A0A0A0MS06 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV23-1A0A0A0MS06 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV23-1A0A0A0MS06 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV23-1A0A0A0MS06 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRBV23-1A0A0A0MS06 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRBV23-1A0A0A0MS06 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRBV23-1A0A0A0MS06 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV23-1A0A0A0MS06 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV23-1A0A0A0MS06 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV23-1A0A0A0MS06 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV23-1A0A0A0MS06 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms