Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3E2

CCDC186, Coiled-coil domain-containing protein 186, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC186Q7Z3E2 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CCDC186Q7Z3E2 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms