Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC12Q8WUD4 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC12Q8WUD4 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms