Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 AGAP4-203ENST00000448048 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 ZNF595-205ENST00000610261 2911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 POLD1-205ENST00000595904 3402 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 MAP7D2-202ENST00000379651 3930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
LTAP01374 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 CCDC186-201ENST00000369285 2035 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 KLHL24-211ENST00000476808 2126 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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LTAP01374 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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LTAP01374 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 CSTF2-203ENST00000415585 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
LTAP01374 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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