Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAI2Q9Y5P3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAI2Q9Y5P3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms