Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NDFIP2Q9NV92 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NDFIP2Q9NV92 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDFIP2Q9NV92 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms