Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUFT1Q9NNX1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUFT1Q9NNX1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms