Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TUFT1Q9NNX1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
TUFT1Q9NNX1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
TUFT1Q9NNX1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TUFT1Q9NNX1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TUFT1Q9NNX1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TUFT1Q9NNX1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
TUFT1Q9NNX1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TUFT1Q9NNX1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TUFT1Q9NNX1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TUFT1Q9NNX1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TUFT1Q9NNX1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
TUFT1Q9NNX1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TUFT1Q9NNX1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TUFT1Q9NNX1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TUFT1Q9NNX1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TUFT1Q9NNX1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TUFT1Q9NNX1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
TUFT1Q9NNX1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
TUFT1Q9NNX1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TUFT1Q9NNX1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TUFT1Q9NNX1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TUFT1Q9NNX1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TUFT1Q9NNX1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TUFT1Q9NNX1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TUFT1Q9NNX1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TUFT1Q9NNX1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TUFT1Q9NNX1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TUFT1Q9NNX1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TUFT1Q9NNX1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
TUFT1Q9NNX1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TUFT1Q9NNX1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TUFT1Q9NNX1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TUFT1Q9NNX1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TUFT1Q9NNX1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TUFT1Q9NNX1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TUFT1Q9NNX1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TUFT1Q9NNX1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
TUFT1Q9NNX1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TUFT1Q9NNX1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TUFT1Q9NNX1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
TUFT1Q9NNX1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
TUFT1Q9NNX1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TUFT1Q9NNX1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TUFT1Q9NNX1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TUFT1Q9NNX1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TUFT1Q9NNX1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
TUFT1Q9NNX1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TUFT1Q9NNX1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TUFT1Q9NNX1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TUFT1Q9NNX1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TUFT1Q9NNX1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TUFT1Q9NNX1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
TUFT1Q9NNX1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TUFT1Q9NNX1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TUFT1Q9NNX1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TUFT1Q9NNX1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TUFT1Q9NNX1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TUFT1Q9NNX1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TUFT1Q9NNX1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
TUFT1Q9NNX1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TUFT1Q9NNX1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
TUFT1Q9NNX1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TUFT1Q9NNX1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TUFT1Q9NNX1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
TUFT1Q9NNX1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TUFT1Q9NNX1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TUFT1Q9NNX1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
TUFT1Q9NNX1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TUFT1Q9NNX1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TUFT1Q9NNX1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33■■■□□ 2.87
TUFT1Q9NNX1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TUFT1Q9NNX1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TUFT1Q9NNX1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
TUFT1Q9NNX1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TUFT1Q9NNX1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
TUFT1Q9NNX1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
TUFT1Q9NNX1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
TUFT1Q9NNX1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TUFT1Q9NNX1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TUFT1Q9NNX1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TUFT1Q9NNX1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TUFT1Q9NNX1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TUFT1Q9NNX1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TUFT1Q9NNX1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TUFT1Q9NNX1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TUFT1Q9NNX1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TUFT1Q9NNX1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TUFT1Q9NNX1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
TUFT1Q9NNX1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TUFT1Q9NNX1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TUFT1Q9NNX1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TUFT1Q9NNX1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TUFT1Q9NNX1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
TUFT1Q9NNX1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TUFT1Q9NNX1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TUFT1Q9NNX1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TUFT1Q9NNX1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TUFT1Q9NNX1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TUFT1Q9NNX1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms