Protein–RNA interactions for Protein: Q96N95

ZNF396, Zinc finger protein 396, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF396Q96N95 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF396Q96N95 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF396Q96N95 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF396Q96N95 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms