Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NSMCE3Q96MG7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NSMCE3Q96MG7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NSMCE3Q96MG7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms