Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NSMCE3Q96MG7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NSMCE3Q96MG7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
NSMCE3Q96MG7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NSMCE3Q96MG7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NSMCE3Q96MG7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NSMCE3Q96MG7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NSMCE3Q96MG7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NSMCE3Q96MG7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NSMCE3Q96MG7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NSMCE3Q96MG7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NSMCE3Q96MG7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
NSMCE3Q96MG7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NSMCE3Q96MG7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
NSMCE3Q96MG7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NSMCE3Q96MG7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NSMCE3Q96MG7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
NSMCE3Q96MG7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NSMCE3Q96MG7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NSMCE3Q96MG7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NSMCE3Q96MG7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NSMCE3Q96MG7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NSMCE3Q96MG7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NSMCE3Q96MG7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NSMCE3Q96MG7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NSMCE3Q96MG7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NSMCE3Q96MG7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NSMCE3Q96MG7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NSMCE3Q96MG7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NSMCE3Q96MG7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSMCE3Q96MG7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NSMCE3Q96MG7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NSMCE3Q96MG7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NSMCE3Q96MG7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NSMCE3Q96MG7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NSMCE3Q96MG7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NSMCE3Q96MG7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NSMCE3Q96MG7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NSMCE3Q96MG7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NSMCE3Q96MG7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NSMCE3Q96MG7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NSMCE3Q96MG7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NSMCE3Q96MG7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NSMCE3Q96MG7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NSMCE3Q96MG7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NSMCE3Q96MG7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NSMCE3Q96MG7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NSMCE3Q96MG7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NSMCE3Q96MG7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
NSMCE3Q96MG7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NSMCE3Q96MG7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NSMCE3Q96MG7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
NSMCE3Q96MG7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NSMCE3Q96MG7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NSMCE3Q96MG7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NSMCE3Q96MG7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NSMCE3Q96MG7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSMCE3Q96MG7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSMCE3Q96MG7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSMCE3Q96MG7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NSMCE3Q96MG7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSMCE3Q96MG7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSMCE3Q96MG7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NSMCE3Q96MG7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NSMCE3Q96MG7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NSMCE3Q96MG7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NSMCE3Q96MG7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NSMCE3Q96MG7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
NSMCE3Q96MG7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSMCE3Q96MG7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSMCE3Q96MG7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NSMCE3Q96MG7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NSMCE3Q96MG7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NSMCE3Q96MG7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NSMCE3Q96MG7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NSMCE3Q96MG7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
NSMCE3Q96MG7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NSMCE3Q96MG7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NSMCE3Q96MG7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NSMCE3Q96MG7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NSMCE3Q96MG7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NSMCE3Q96MG7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NSMCE3Q96MG7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSMCE3Q96MG7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NSMCE3Q96MG7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NSMCE3Q96MG7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSMCE3Q96MG7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NSMCE3Q96MG7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
NSMCE3Q96MG7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NSMCE3Q96MG7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSMCE3Q96MG7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NSMCE3Q96MG7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NSMCE3Q96MG7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NSMCE3Q96MG7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NSMCE3Q96MG7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NSMCE3Q96MG7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NSMCE3Q96MG7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NSMCE3Q96MG7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NSMCE3Q96MG7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NSMCE3Q96MG7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms