Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VTI1AQ96AJ9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VTI1AQ96AJ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms