Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
C15orf39Q6ZRI6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C15orf39Q6ZRI6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C15orf39Q6ZRI6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms