Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ASIC2Q16515 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ASIC2Q16515 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ASIC2Q16515 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms