Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYH11P35749 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYH11P35749 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYH11P35749 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYH11P35749 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYH11P35749 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MYH11P35749 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYH11P35749 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYH11P35749 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYH11P35749 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYH11P35749 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYH11P35749 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYH11P35749 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYH11P35749 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MYH11P35749 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MYH11P35749 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYH11P35749 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYH11P35749 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYH11P35749 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYH11P35749 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYH11P35749 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYH11P35749 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MYH11P35749 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MYH11P35749 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MYH11P35749 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MYH11P35749 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MYH11P35749 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYH11P35749 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYH11P35749 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYH11P35749 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYH11P35749 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYH11P35749 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYH11P35749 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYH11P35749 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYH11P35749 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MYH11P35749 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MYH11P35749 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYH11P35749 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYH11P35749 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYH11P35749 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYH11P35749 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYH11P35749 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYH11P35749 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYH11P35749 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYH11P35749 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYH11P35749 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MYH11P35749 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYH11P35749 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYH11P35749 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYH11P35749 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYH11P35749 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MYH11P35749 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYH11P35749 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYH11P35749 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYH11P35749 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYH11P35749 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYH11P35749 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYH11P35749 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYH11P35749 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYH11P35749 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYH11P35749 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYH11P35749 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYH11P35749 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYH11P35749 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYH11P35749 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYH11P35749 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYH11P35749 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYH11P35749 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYH11P35749 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYH11P35749 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYH11P35749 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYH11P35749 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYH11P35749 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYH11P35749 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYH11P35749 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYH11P35749 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYH11P35749 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms