Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 GIN1-205ENST00000512248 3325 ntTSL 1 (best)8.33□□□□□ -1.086e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PRKCH-202ENST00000536400 968 ntTSL 28.3□□□□□ -1.086e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 CCDC18-AS1-220ENST00000452347 969 ntTSL 28.2□□□□□ -1.16e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NAPA-218ENST00000598615 379 ntTSL 37.99□□□□□ -1.136e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 ADGRV1-215ENST00000638990 2433 ntTSL 57.9□□□□□ -1.146e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 ACO1-201ENST00000309951 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.186e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 FGGY-208ENST00000462744 693 ntTSL 57.49□□□□□ -1.216e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 ADGRV1-233ENST00000640407 5673 ntTSL 57.35□□□□□ -1.236e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 CFAP161-203ENST00000561216 572 ntTSL 47.31□□□□□ -1.246e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 CFAP161-202ENST00000560091 574 ntTSL 57.14□□□□□ -1.276e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 FGGY-220ENST00000583635 471 ntTSL 47.06□□□□□ -1.286e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 CTDSPL-208ENST00000486978 609 ntTSL 37.01□□□□□ -1.296e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SVIL-AS1-203ENST00000423223 507 ntTSL 26.51□□□□□ -1.376e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 CCDC18-AS1-211ENST00000438777 752 ntTSL 35.99□□□□□ -1.456e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 ADGRV1-211ENST00000638510 6503 ntTSL 1 (best)5.66□□□□□ -1.56e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.616e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.646e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 PCCA-205ENST00000424527 447 ntTSL 34.43□□□□□ -1.76e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GALNTL6-201ENST00000457021 3068 ntTSL 1 (best)4.36□□□□□ -1.716e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GIN1-202ENST00000507478 462 ntTSL 23.96□□□□□ -1.776e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 GIN1-207ENST00000513747 525 ntTSL 33.58□□□□□ -1.846e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 HFM1-203ENST00000430465 1928 ntTSL 1 (best)2.67□□□□□ -1.986e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 SVIL-AS1-209ENST00000455774 478 ntTSL 32.04□□□□□ -2.086e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 USP32-205ENST00000586881 329 ntTSL 41.38□□□□□ -2.196e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 HFM1-206ENST00000462405 2667 ntTSL 2-0.26□□□□□ -2.456e-10■■■■■ 187.2
SF3B1O75533 NPRL3-203ENST00000422814 512 ntTSL 419.27■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 186.9
SF3B1O75533 NPRL3-205ENST00000457916 936 ntTSL 519.27■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 186.9
SF3B1O75533 NPRL3-209ENST00000483663 932 ntTSL 314.04□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 186.9
SF3B1O75533 NPRL3-207ENST00000468260 922 ntTSL 511.9□□□□□ -0.59e-7■■■■■ 186.9
SF3B1O75533 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-209ENST00000596929 543 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.273e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-203ENST00000594384 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-208ENST00000596825 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.423e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-213ENST00000599227 3587 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.63e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-215ENST00000599953 2274 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.633e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-204ENST00000595981 895 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-212ENST00000598880 570 ntTSL 510.41□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.043e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-216ENST00000600044 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC8.25□□□□□ -1.093e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.09□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ZNF544-207ENST00000596677 4109 ntTSL 57.25□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 186.8
SF3B1O75533 ACVR1-203ENST00000410057 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 186.7
SF3B1O75533 ACVR1-202ENST00000409283 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.813e-8■■■■■ 186.7
SF3B1O75533 PI4KA-205ENST00000466162 589 ntTSL 49.8□□□□□ -0.842e-18■■■■■ 186.7
SF3B1O75533 SAMD5-202ENST00000566741 393 ntTSL 36.24□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 186.7
SF3B1O75533 AL033504.1-202ENST00000432506 406 ntTSL 22.99□□□□□ -1.931e-6■■■■■ 186.7
SF3B1O75533 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 186.5
SF3B1O75533 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 186.5
SF3B1O75533 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 186.5
SF3B1O75533 NRBP1-206ENST00000460499 2561 ntTSL 214.85□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 186.5
SF3B1O75533 PPP2R5A-202ENST00000479259 740 ntTSL 57.01□□□□□ -1.297e-9■■■■■ 185.7
SF3B1O75533 PPP2R5A-204ENST00000498129 745 ntTSL 52.4□□□□□ -2.037e-9■■■■■ 185.7
SF3B1O75533 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 185.2
SF3B1O75533 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.741e-9■■■■■ 184.6
SF3B1O75533 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.411e-9■■■■■ 184.6
SF3B1O75533 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.161e-9■■■■■ 184.6
SF3B1O75533 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.921e-9■■■■■ 184.6
SF3B1O75533 ACAA1-203ENST00000411549 1944 ntTSL 1 (best)20.69■□□□□ 0.91e-9■■■■■ 184.6
SF3B1O75533 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.871e-9■■■■■ 184.6
SF3B1O75533 ACAA1-205ENST00000421218 869 ntTSL 519.19■□□□□ 0.661e-9■■■■■ 184.6
SF3B1O75533 ACAA1-216ENST00000480865 1540 ntTSL 516.39■□□□□ 0.211e-9■■■■■ 184.6
SF3B1O75533 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 184.6
SF3B1O75533 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 184.6
SF3B1O75533 ZSWIM8-212ENST00000492395 4490 ntTSL 1 (best)12.56□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 184.4
SF3B1O75533 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.352e-6■■■■■ 184
SF3B1O75533 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 184
SF3B1O75533 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 184
SF3B1O75533 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 184
SF3B1O75533 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 184
SF3B1O75533 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.977e-8■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 FAM35A-203ENST00000437629 969 ntTSL 326.36■■□□□ 1.817e-8■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.717e-8■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 DAPK2-207ENST00000558482 909 ntTSL 1 (best)21.36■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.696e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.686e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 CREB1-204ENST00000421139 713 ntTSL 519.07■□□□□ 0.643e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 MIB2-213ENST00000487053 3252 ntTSL 518.9■□□□□ 0.626e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 DAPK2-211ENST00000559897 570 ntTSL 418.25■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.476e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.446e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.416e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 TRIM41-206ENST00000514219 459 ntTSL 517.03■□□□□ 0.321e-22■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 MIB2-214ENST00000489635 3034 ntTSL 216.46■□□□□ 0.236e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 MIB2-210ENST00000479659 4247 ntTSL 216.05■□□□□ 0.166e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 MIB2-226ENST00000511502 3326 ntTSL 215.93■□□□□ 0.146e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 ANKRD11-216ENST00000568924 587 ntTSL 415.01□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 PSTPIP2-202ENST00000587042 859 ntTSL 214.52□□□□□ -0.083e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.211e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 DAPK2-208ENST00000559007 4835 ntTSL 513.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 MYO18A-219ENST00000585573 319 ntTSL 312.98□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 PROS1-202ENST00000394236 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 PSTPIP2-201ENST00000409746 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 DAPK2-213ENST00000612884 8086 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 PSTPIP2-204ENST00000589328 2900 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.583e-11■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 183.8
SF3B1O75533 DAPK2-201ENST00000261891 2603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 183.8
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 288.2 ms