RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437629.6

FAM35A-203, Transcript of Protein FAM35A, humanhuman

TSL 3

Gene FAM35A, Length 969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM35A-203ENST00000437629 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.34■■■■■ 7.09
FAM35A-203ENST00000437629 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.01■■■■■ 6.08
FAM35A-203ENST00000437629 ABCC9O60706 1549 aa52.43■■■■■ 5.98
FAM35A-203ENST00000437629 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.18■■■■■ 5.62
FAM35A-203ENST00000437629 NACADO15069 1562 aa49.99■■■■■ 5.59
FAM35A-203ENST00000437629 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.82■■■■■ 5.57
FAM35A-203ENST00000437629 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.5■■■■■ 5.51
FAM35A-203ENST00000437629 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.3■■■■■ 5.48
FAM35A-203ENST00000437629 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.07■■■■■ 5.45
FAM35A-203ENST00000437629 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.05■■■■■ 5.44
FAM35A-203ENST00000437629 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.9■■■■■ 5.42
FAM35A-203ENST00000437629 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.69■■■■■ 5.39
FAM35A-203ENST00000437629 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.68■■■■■ 5.38
FAM35A-203ENST00000437629 SCRIBQ14160 1630 aa48.31■■■■■ 5.32
FAM35A-203ENST00000437629 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.11■■■■■ 5.29
FAM35A-203ENST00000437629 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
FAM35A-203ENST00000437629 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.41■■■■■ 5.18
FAM35A-203ENST00000437629 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.17■■■■■ 5.14
FAM35A-203ENST00000437629 SMARCA4P51532 1647 aa46.17■■■■■ 4.98
FAM35A-203ENST00000437629 NCAPD3P42695 1498 aa46.13■■■■■ 4.98
FAM35A-203ENST00000437629 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.06■■■■■ 4.96
FAM35A-203ENST00000437629 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.03■■■■■ 4.96
FAM35A-203ENST00000437629 SMARCA2P51531 1590 aa45.97■■■■■ 4.95
FAM35A-203ENST00000437629 HMGXB3Q12766 1538 aa45.84■■■■■ 4.93
FAM35A-203ENST00000437629 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.72■■■■■ 4.91
FAM35A-203ENST00000437629 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.72■■■■■ 4.91
FAM35A-203ENST00000437629 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.65■■■■■ 4.9
FAM35A-203ENST00000437629 ERCC6Q03468 1493 aa45.23■■■■■ 4.83
FAM35A-203ENST00000437629 NESP48681 1621 aa45.2■■■■■ 4.83
FAM35A-203ENST00000437629 WIZO95785 1651 aa45.2■■■■■ 4.83
FAM35A-203ENST00000437629 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.01■■■■■ 4.8
FAM35A-203ENST00000437629 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.99■■■■■ 4.79
FAM35A-203ENST00000437629 CUX2O14529 1486 aa44.98■■■■■ 4.79
FAM35A-203ENST00000437629 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.76■■■■■ 4.76
FAM35A-203ENST00000437629 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.73■■■■■ 4.75
FAM35A-203ENST00000437629 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
FAM35A-203ENST00000437629 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.65■■■■■ 4.74
FAM35A-203ENST00000437629 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.64■■■■■ 4.74
FAM35A-203ENST00000437629 CFTRP13569 1480 aa44.36■■■■■ 4.69
FAM35A-203ENST00000437629 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.3■■■■■ 4.68
FAM35A-203ENST00000437629 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.29■■■■■ 4.68
FAM35A-203ENST00000437629 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.24■■■■■ 4.67
FAM35A-203ENST00000437629 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.23■■■■■ 4.67
FAM35A-203ENST00000437629 WDR62O43379 1518 aa44.17■■■■■ 4.66
FAM35A-203ENST00000437629 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.16■■■■■ 4.66
FAM35A-203ENST00000437629 PRDM2Q13029 1718 aa43.99■■■■■ 4.63
FAM35A-203ENST00000437629 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
FAM35A-203ENST00000437629 TOPBP1Q92547 1522 aa43.47■■■■■ 4.55
FAM35A-203ENST00000437629 ABCC8Q09428 1581 aa43.44■■■■■ 4.54
FAM35A-203ENST00000437629 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
FAM35A-203ENST00000437629 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.37■■■■■ 4.53
FAM35A-203ENST00000437629 IFT140Q96RY7 1462 aa43.33■■■■■ 4.53
FAM35A-203ENST00000437629 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
FAM35A-203ENST00000437629 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
FAM35A-203ENST00000437629 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.04■■■■■ 4.48
FAM35A-203ENST00000437629 OSCARQ8IYS5 282 aa43.02■■■■■ 4.48
FAM35A-203ENST00000437629 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
FAM35A-203ENST00000437629 CUX1P39880 1505 aa42.92■■■■■ 4.46
FAM35A-203ENST00000437629 SOGA1O94964 1423 aa42.88■■■■■ 4.46
FAM35A-203ENST00000437629 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.88■■■■■ 4.469e-10■■■■□ 21
FAM35A-203ENST00000437629 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.88■■■■■ 4.46
FAM35A-203ENST00000437629 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.87■■■■■ 4.45
FAM35A-203ENST00000437629 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
FAM35A-203ENST00000437629 WDR97A6NE52 1622 aa42.67■■■■■ 4.42
FAM35A-203ENST00000437629 CHD1O14646 1710 aa42.57■■■■■ 4.41
FAM35A-203ENST00000437629 TRIM41Q8WV44 630 aa42.57■■■■■ 4.41
FAM35A-203ENST00000437629 FBLN2P98095 1184 aa42.48■■■■■ 4.39
FAM35A-203ENST00000437629 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.46■■■■■ 4.39
FAM35A-203ENST00000437629 GRIN2BQ13224 1484 aa42.44■■■■■ 4.38
FAM35A-203ENST00000437629 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.43■■■■■ 4.38
FAM35A-203ENST00000437629 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.43■■■■■ 4.38
FAM35A-203ENST00000437629 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.41■■■■■ 4.38
FAM35A-203ENST00000437629 TOP2BQ02880 1626 aa42.4■■■■■ 4.38
FAM35A-203ENST00000437629 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.39■■■■■ 4.38
FAM35A-203ENST00000437629 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.38■■■■■ 4.38
FAM35A-203ENST00000437629 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.38■■■■■ 4.38
FAM35A-203ENST00000437629 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.38■■■■■ 4.38
FAM35A-203ENST00000437629 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.37■■■■■ 4.37
FAM35A-203ENST00000437629 SYNJ1O43426 1573 aa42.35■■■■■ 4.37
FAM35A-203ENST00000437629 PBRM1Q86U86 1689 aa42.31■■■■■ 4.36
FAM35A-203ENST00000437629 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.31■■■■■ 4.36
FAM35A-203ENST00000437629 ARHGEF11O15085 1522 aa42.3■■■■■ 4.36
FAM35A-203ENST00000437629 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.28■■■■■ 4.36
FAM35A-203ENST00000437629 SYNJ2O15056 1496 aa42.23■■■■■ 4.35
FAM35A-203ENST00000437629 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.1■■■■■ 4.33
FAM35A-203ENST00000437629 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.96■■■■■ 4.31
FAM35A-203ENST00000437629 ADAMTS12P58397 1594 aa41.94■■■■■ 4.3
FAM35A-203ENST00000437629 ARAP1Q96P48 1450 aa41.93■■■■■ 4.3
FAM35A-203ENST00000437629 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.91■■■■■ 4.3
FAM35A-203ENST00000437629 GRIN2AQ12879 1464 aa41.89■■■■■ 4.3
FAM35A-203ENST00000437629 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.86■■■■■ 4.29
FAM35A-203ENST00000437629 NUP160Q12769 1436 aa41.74■■■■■ 4.27
FAM35A-203ENST00000437629 CEP170Q5SW79 1584 aa41.71■■■■■ 4.27
FAM35A-203ENST00000437629 KIF27Q86VH2 1401 aa41.59■■■■■ 4.25
FAM35A-203ENST00000437629 IGF1RP08069 1367 aa41.5■■■■■ 4.23
FAM35A-203ENST00000437629 SHROOM2Q13796 1616 aa41.49■■■■■ 4.23
FAM35A-203ENST00000437629 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.47■■■■■ 4.23
FAM35A-203ENST00000437629 CUL7Q14999 1698 aa41.42■■■■■ 4.22
FAM35A-203ENST00000437629 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.34■■■■■ 4.21
FAM35A-203ENST00000437629 JPH4Q96JJ6 628 aa41.32■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms