Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP3M2P53677 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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