Protein–RNA interactions for Protein: P30520

ADSS, Adenylosuccinate synthetase isozyme 2, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADSSP30520 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ADSSP30520 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ADSSP30520 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ADSSP30520 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ADSSP30520 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ADSSP30520 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ADSSP30520 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ADSSP30520 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ADSSP30520 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms