Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PMS2P11Q13670 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 MTSS1-201ENST00000325064 2777 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 FLT4-201ENST00000261937 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PMS2P11Q13670 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms