Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PMS2P11Q13670 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PMS2P11Q13670 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PMS2P11Q13670 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMS2P11Q13670 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PMS2P11Q13670 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PMS2P11Q13670 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PMS2P11Q13670 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PMS2P11Q13670 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PMS2P11Q13670 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PMS2P11Q13670 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PMS2P11Q13670 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PMS2P11Q13670 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PMS2P11Q13670 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PMS2P11Q13670 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PMS2P11Q13670 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PMS2P11Q13670 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PMS2P11Q13670 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PMS2P11Q13670 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PMS2P11Q13670 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PMS2P11Q13670 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P11Q13670 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P11Q13670 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P11Q13670 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P11Q13670 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P11Q13670 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PMS2P11Q13670 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PMS2P11Q13670 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PMS2P11Q13670 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P11Q13670 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P11Q13670 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P11Q13670 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PMS2P11Q13670 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P11Q13670 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P11Q13670 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P11Q13670 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PMS2P11Q13670 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P11Q13670 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS2P11Q13670 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS2P11Q13670 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P11Q13670 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P11Q13670 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P11Q13670 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMS2P11Q13670 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PMS2P11Q13670 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PMS2P11Q13670 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PMS2P11Q13670 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMS2P11Q13670 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMS2P11Q13670 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMS2P11Q13670 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMS2P11Q13670 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMS2P11Q13670 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMS2P11Q13670 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMS2P11Q13670 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P11Q13670 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PMS2P11Q13670 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PMS2P11Q13670 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PMS2P11Q13670 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PMS2P11Q13670 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PMS2P11Q13670 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P11Q13670 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P11Q13670 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PMS2P11Q13670 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PMS2P11Q13670 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PMS2P11Q13670 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P11Q13670 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PMS2P11Q13670 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PMS2P11Q13670 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P11Q13670 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PMS2P11Q13670 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P11Q13670 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PMS2P11Q13670 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PMS2P11Q13670 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P11Q13670 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PMS2P11Q13670 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P11Q13670 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PMS2P11Q13670 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PMS2P11Q13670 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P11Q13670 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PMS2P11Q13670 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PMS2P11Q13670 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PMS2P11Q13670 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P11Q13670 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PMS2P11Q13670 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PMS2P11Q13670 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P11Q13670 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PMS2P11Q13670 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P11Q13670 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS2P11Q13670 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P11Q13670 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P11Q13670 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS2P11Q13670 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P11Q13670 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P11Q13670 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS2P11Q13670 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P11Q13670 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS2P11Q13670 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS2P11Q13670 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS2P11Q13670 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS2P11Q13670 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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