Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN4Q92575 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms