Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NMUP48645 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NMUP48645 SLC39A13-204ENST00000524928 3553 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NMUP48645 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NMUP48645 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NMUP48645 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NMUP48645 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
NMUP48645 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
NMUP48645 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 AP000350.6-201ENST00000609510 5637 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 HAUS5-201ENST00000203166 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 ATP2C1-221ENST00000513801 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 PTPN1-201ENST00000371621 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 AC005041.1-201ENST00000517883 7033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 FAM160B2-201ENST00000289921 4245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 BTBD11-202ENST00000357167 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 GUCY1B3-202ENST00000502959 2255 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 NUMA1-202ENST00000358965 7227 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 NEPRO-201ENST00000314400 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 WASHC5-201ENST00000318410 4187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 RHBDL3-201ENST00000269051 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 PDGFD-201ENST00000302251 4052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NMUP48645 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 ZNF564-201ENST00000339282 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 SPTB-204ENST00000389722 10063 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 LRTM2-201ENST00000299194 3688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 AGGF1-201ENST00000312916 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NMUP48645 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms