Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GPC3P51654 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GPC3P51654 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms