Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.05■■■■□ 3.68
GPC3P51654 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GPC3P51654 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GPC3P51654 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GPC3P51654 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
GPC3P51654 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
GPC3P51654 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
GPC3P51654 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPC3P51654 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
GPC3P51654 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
GPC3P51654 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
GPC3P51654 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GPC3P51654 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
GPC3P51654 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
GPC3P51654 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
GPC3P51654 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
GPC3P51654 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
GPC3P51654 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.22
GPC3P51654 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
GPC3P51654 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
GPC3P51654 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
GPC3P51654 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
GPC3P51654 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
GPC3P51654 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
GPC3P51654 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GPC3P51654 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GPC3P51654 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GPC3P51654 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GPC3P51654 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GPC3P51654 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GPC3P51654 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GPC3P51654 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GPC3P51654 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GPC3P51654 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
GPC3P51654 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
GPC3P51654 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GPC3P51654 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GPC3P51654 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
GPC3P51654 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GPC3P51654 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
GPC3P51654 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GPC3P51654 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GPC3P51654 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GPC3P51654 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
GPC3P51654 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GPC3P51654 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
GPC3P51654 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
GPC3P51654 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GPC3P51654 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
GPC3P51654 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GPC3P51654 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
GPC3P51654 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GPC3P51654 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GPC3P51654 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
GPC3P51654 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.9
GPC3P51654 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
GPC3P51654 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GPC3P51654 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
GPC3P51654 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GPC3P51654 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GPC3P51654 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GPC3P51654 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GPC3P51654 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
GPC3P51654 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GPC3P51654 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GPC3P51654 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GPC3P51654 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GPC3P51654 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
GPC3P51654 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
GPC3P51654 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GPC3P51654 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GPC3P51654 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GPC3P51654 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GPC3P51654 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
GPC3P51654 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GPC3P51654 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GPC3P51654 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GPC3P51654 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GPC3P51654 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
GPC3P51654 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GPC3P51654 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GPC3P51654 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GPC3P51654 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GPC3P51654 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
GPC3P51654 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GPC3P51654 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GPC3P51654 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GPC3P51654 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GPC3P51654 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GPC3P51654 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
GPC3P51654 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GPC3P51654 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
GPC3P51654 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GPC3P51654 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GPC3P51654 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GPC3P51654 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GPC3P51654 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GPC3P51654 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GPC3P51654 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
GPC3P51654 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms