Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNX10Q9Y5X0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX10Q9Y5X0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX10Q9Y5X0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.4 ms