Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SNX10Q9Y5X0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SNX10Q9Y5X0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
SNX10Q9Y5X0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
SNX10Q9Y5X0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SNX10Q9Y5X0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SNX10Q9Y5X0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SNX10Q9Y5X0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNX10Q9Y5X0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SNX10Q9Y5X0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SNX10Q9Y5X0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SNX10Q9Y5X0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SNX10Q9Y5X0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SNX10Q9Y5X0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SNX10Q9Y5X0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SNX10Q9Y5X0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
SNX10Q9Y5X0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SNX10Q9Y5X0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SNX10Q9Y5X0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SNX10Q9Y5X0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SNX10Q9Y5X0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SNX10Q9Y5X0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
SNX10Q9Y5X0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
SNX10Q9Y5X0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SNX10Q9Y5X0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SNX10Q9Y5X0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SNX10Q9Y5X0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SNX10Q9Y5X0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SNX10Q9Y5X0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
SNX10Q9Y5X0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SNX10Q9Y5X0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SNX10Q9Y5X0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SNX10Q9Y5X0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SNX10Q9Y5X0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SNX10Q9Y5X0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SNX10Q9Y5X0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SNX10Q9Y5X0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SNX10Q9Y5X0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SNX10Q9Y5X0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SNX10Q9Y5X0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SNX10Q9Y5X0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SNX10Q9Y5X0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNX10Q9Y5X0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNX10Q9Y5X0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SNX10Q9Y5X0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SNX10Q9Y5X0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SNX10Q9Y5X0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SNX10Q9Y5X0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SNX10Q9Y5X0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SNX10Q9Y5X0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SNX10Q9Y5X0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
SNX10Q9Y5X0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SNX10Q9Y5X0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SNX10Q9Y5X0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SNX10Q9Y5X0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SNX10Q9Y5X0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNX10Q9Y5X0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNX10Q9Y5X0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SNX10Q9Y5X0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SNX10Q9Y5X0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SNX10Q9Y5X0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SNX10Q9Y5X0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SNX10Q9Y5X0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SNX10Q9Y5X0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SNX10Q9Y5X0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SNX10Q9Y5X0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SNX10Q9Y5X0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SNX10Q9Y5X0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SNX10Q9Y5X0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNX10Q9Y5X0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
SNX10Q9Y5X0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SNX10Q9Y5X0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SNX10Q9Y5X0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SNX10Q9Y5X0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SNX10Q9Y5X0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SNX10Q9Y5X0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SNX10Q9Y5X0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SNX10Q9Y5X0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SNX10Q9Y5X0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SNX10Q9Y5X0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SNX10Q9Y5X0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SNX10Q9Y5X0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SNX10Q9Y5X0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SNX10Q9Y5X0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SNX10Q9Y5X0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNX10Q9Y5X0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SNX10Q9Y5X0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SNX10Q9Y5X0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SNX10Q9Y5X0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNX10Q9Y5X0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNX10Q9Y5X0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX10Q9Y5X0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SNX10Q9Y5X0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SNX10Q9Y5X0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SNX10Q9Y5X0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SNX10Q9Y5X0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SNX10Q9Y5X0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SNX10Q9Y5X0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SNX10Q9Y5X0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SNX10Q9Y5X0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms