Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SLCO1C1Q9NYB5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SLCO1C1Q9NYB5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms