Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM260Q9NX78 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TMEM260Q9NX78 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM260Q9NX78 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms