Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 MAD1L1-221ENST00000486340 646 ntTSL 326.59■■□□□ 1.854e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRHPR-202ENST00000377824 1844 ntTSL 226.29■■□□□ 1.84e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 THRB-212ENST00000453729 703 ntTSL 1 (best)26.24■■□□□ 1.794e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 NOL4L-208ENST00000475781 1127 ntTSL 526.13■■□□□ 1.774e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.764e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRHPR-208ENST00000493368 1136 ntTSL 1 (best)25.9■■□□□ 1.744e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 SCAMP3-207ENST00000480219 752 ntTSL 225.88■■□□□ 1.734e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 FAM208B-206ENST00000477043 514 ntTSL 225.35■■□□□ 1.654e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.624e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRHPR-203ENST00000460882 1080 ntTSL 1 (best)25.07■■□□□ 1.64e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-208ENST00000471927 556 ntTSL 424.98■■□□□ 1.594e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-209ENST00000473197 595 ntTSL 424.98■■□□□ 1.594e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.574e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.524e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-206ENST00000464397 583 ntTSL 224.51■■□□□ 1.514e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.54e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-203ENST00000585512 562 ntTSL 424.41■■□□□ 1.54e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.494e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 TSKU-204ENST00000533752 643 ntTSL 424.3■■□□□ 1.484e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-207ENST00000587109 535 ntTSL 224.2■■□□□ 1.464e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.464e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 NUTF2-204ENST00000568390 593 ntTSL 324.17■■□□□ 1.464e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.444e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.444e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-219ENST00000592323 550 ntTSL 423.78■■□□□ 1.44e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 UBXN6-208ENST00000592358 626 ntTSL 223.76■■□□□ 1.394e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-220ENST00000592783 541 ntTSL 423.52■■□□□ 1.364e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 OTUB1-201ENST00000301453 2493 ntTSL 223.39■■□□□ 1.344e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-212ENST00000588170 588 ntTSL 223.09■■□□□ 1.294e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-218ENST00000591740 585 ntTSL 423.09■■□□□ 1.294e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-205ENST00000461290 1018 ntTSL 222.98■■□□□ 1.274e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.274e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-209ENST00000587518 526 ntTSL 422.95■■□□□ 1.264e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-211ENST00000588143 546 ntTSL 322.92■■□□□ 1.264e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-210ENST00000587958 560 ntTSL 222.88■■□□□ 1.254e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-208ENST00000587387 614 ntTSL 422.88■■□□□ 1.254e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.254e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.244e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 ANKHD1-207ENST00000421134 4814 ntTSL 522.31■■□□□ 1.164e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-207ENST00000469844 612 ntTSL 422.17■■□□□ 1.144e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 NUTF2-202ENST00000567105 582 ntTSL 322.05■■□□□ 1.124e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-206ENST00000586782 843 ntTSL 521.42■■□□□ 1.024e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 14e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 THRB-207ENST00000418247 592 ntTSL 221.14■□□□□ 0.984e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.874e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 TBCD-214ENST00000574801 586 ntTSL 420.37■□□□□ 0.854e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GRN-213ENST00000588237 558 ntTSL 520.27■□□□□ 0.844e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT2-213ENST00000551899 572 ntTSL 419.96■□□□□ 0.794e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 NUTF2-203ENST00000568233 589 ntTSL 219.85■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.734e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 AC022098.1-201ENST00000588387 2861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 UBXN6-209ENST00000592515 403 ntTSL 519.43■□□□□ 0.74e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 UBXN6-205ENST00000588238 4598 nt19.24■□□□□ 0.674e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 C16orf52-204ENST00000562695 695 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 NAXE-204ENST00000467374 779 ntTSL 218.17■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 AC022098.1-203ENST00000592086 449 ntTSL 316.59■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 SND1-208ENST00000470463 530 ntTSL 416.57■□□□□ 0.244e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT2-210ENST00000550638 683 ntTSL 216.5■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 THRB-208ENST00000428492 539 ntTSL 416.47■□□□□ 0.234e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 COX7A2-208ENST00000509698 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.224e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT2-212ENST00000551620 776 ntTSL 216.38■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT2-207ENST00000549933 536 ntTSL 216.38■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT2-209ENST00000550455 481 ntTSL 216.38■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 THRB-206ENST00000416420 2571 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.24e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 SLC7A8-204ENST00000422941 3018 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 COPG2-202ENST00000425248 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-210ENST00000473786 811 ntTSL 515.72■□□□□ 0.114e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 THRB-211ENST00000447875 754 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.094e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 SLC7A8-203ENST00000397310 2719 ntTSL 214.41□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT2-203ENST00000544368 1728 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 SLC7A8-201ENST00000316902 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 COX7A2-202ENST00000370089 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT2-205ENST00000546859 595 ntTSL 213.63□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.294e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT2-208ENST00000550010 1754 ntTSL 512.9□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 THRB-209ENST00000431815 568 ntTSL 1 (best)12.44□□□□□ -0.424e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 C16orf52-203ENST00000562186 605 ntTSL 312.2□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 SLC7A8-206ENST00000469263 3557 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 SLC7A8-202ENST00000339733 3066 ntTSL 1 (best)12.13□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 COX7A2-207ENST00000481061 914 ntTSL 211.15□□□□□ -0.634e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 COPG2-203ENST00000617523 2142 ntTSL 510.84□□□□□ -0.674e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 CCT7-214ENST00000492253 531 ntTSL 410.58□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 THRB-205ENST00000415021 671 ntTSL 1 (best)10.21□□□□□ -0.784e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 THRB-202ENST00000356447 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.914e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.934e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.244e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.284e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.364e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 COX7A2-203ENST00000377978 366 ntTSL 53.8□□□□□ -1.84e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 COX7A2-204ENST00000459637 501 ntTSL 23.63□□□□□ -1.834e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.4□□□□□ -2.634e-6■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 DNM1-218ENST00000635859 100 ntTSL 526.03■■□□□ 1.764e-11■■■■■ 30.2
DROSHAQ9NRR4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.451e-9■■■■■ 30.2
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