RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592358.1

UBXN6-208, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 2

Gene UBXN6, Length 626 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-208ENST00000592358 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.46■■■■□ 3.43
UBXN6-208ENST00000592358 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.52■■■□□ 2.8
UBXN6-208ENST00000592358 ABCC9O60706 1549 aa32.31■■■□□ 2.76
UBXN6-208ENST00000592358 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.66■■■□□ 2.5
UBXN6-208ENST00000592358 NACADO15069 1562 aa30.57■■■□□ 2.48
UBXN6-208ENST00000592358 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.56■■■□□ 2.48
UBXN6-208ENST00000592358 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.5■■■□□ 2.47
UBXN6-208ENST00000592358 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
UBXN6-208ENST00000592358 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.32■■■□□ 2.44
UBXN6-208ENST00000592358 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.17■■■□□ 2.42
UBXN6-208ENST00000592358 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.16■■■□□ 2.42
UBXN6-208ENST00000592358 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.94■■■□□ 2.38
UBXN6-208ENST00000592358 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.7■■■□□ 2.35
UBXN6-208ENST00000592358 SCRIBQ14160 1630 aa29.68■■■□□ 2.34
UBXN6-208ENST00000592358 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.42■■■□□ 2.3
UBXN6-208ENST00000592358 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.12■■■□□ 2.25
UBXN6-208ENST00000592358 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.09■■■□□ 2.25
UBXN6-208ENST00000592358 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
UBXN6-208ENST00000592358 SMARCA4P51532 1647 aa28.36■■■□□ 2.13
UBXN6-208ENST00000592358 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
UBXN6-208ENST00000592358 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.19■■■□□ 2.1
UBXN6-208ENST00000592358 SMARCA2P51531 1590 aa28.19■■■□□ 2.1
UBXN6-208ENST00000592358 NCAPD3P42695 1498 aa28.17■■■□□ 2.1
UBXN6-208ENST00000592358 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.16■■■□□ 2.1
UBXN6-208ENST00000592358 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.1■■■□□ 2.09
UBXN6-208ENST00000592358 HMGXB3Q12766 1538 aa28.08■■■□□ 2.09
UBXN6-208ENST00000592358 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.04■■■□□ 2.08
UBXN6-208ENST00000592358 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
UBXN6-208ENST00000592358 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
UBXN6-208ENST00000592358 ERCC6Q03468 1493 aa27.89■■■□□ 2.06
UBXN6-208ENST00000592358 WIZO95785 1651 aa27.81■■■□□ 2.04
UBXN6-208ENST00000592358 CUX2O14529 1486 aa27.8■■■□□ 2.04
UBXN6-208ENST00000592358 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.78■■■□□ 2.04
UBXN6-208ENST00000592358 NESP48681 1621 aa27.69■■■□□ 2.02
UBXN6-208ENST00000592358 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
UBXN6-208ENST00000592358 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.51■■□□□ 1.99
UBXN6-208ENST00000592358 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.35■■□□□ 1.97
UBXN6-208ENST00000592358 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
UBXN6-208ENST00000592358 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.31■■□□□ 1.96
UBXN6-208ENST00000592358 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.27■■□□□ 1.96
UBXN6-208ENST00000592358 CFTRP13569 1480 aa27.18■■□□□ 1.94
UBXN6-208ENST00000592358 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.15■■□□□ 1.94
UBXN6-208ENST00000592358 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.08■■□□□ 1.93
UBXN6-208ENST00000592358 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.07■■□□□ 1.92
UBXN6-208ENST00000592358 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.06■■□□□ 1.92
UBXN6-208ENST00000592358 PRDM2Q13029 1718 aa27.02■■□□□ 1.92
UBXN6-208ENST00000592358 WDR62O43379 1518 aa26.96■■□□□ 1.91
UBXN6-208ENST00000592358 TRIM41Q8WV44 630 aa26.96■■□□□ 1.91
UBXN6-208ENST00000592358 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
UBXN6-208ENST00000592358 OSCARQ8IYS5 282 aa26.69■■□□□ 1.86
UBXN6-208ENST00000592358 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.66■■□□□ 1.86
UBXN6-208ENST00000592358 TOPBP1Q92547 1522 aa26.63■■□□□ 1.85
UBXN6-208ENST00000592358 ABCC8Q09428 1581 aa26.61■■□□□ 1.85
UBXN6-208ENST00000592358 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.61■■□□□ 1.85
UBXN6-208ENST00000592358 IFT140Q96RY7 1462 aa26.49■■□□□ 1.83
UBXN6-208ENST00000592358 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
UBXN6-208ENST00000592358 CUX1P39880 1505 aa26.38■■□□□ 1.81
UBXN6-208ENST00000592358 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
UBXN6-208ENST00000592358 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
UBXN6-208ENST00000592358 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.32■■□□□ 1.8
UBXN6-208ENST00000592358 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
UBXN6-208ENST00000592358 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.27■■□□□ 1.8
UBXN6-208ENST00000592358 SOGA1O94964 1423 aa26.26■■□□□ 1.79
UBXN6-208ENST00000592358 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.23■■□□□ 1.79
UBXN6-208ENST00000592358 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.23■■□□□ 1.79
UBXN6-208ENST00000592358 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.23■■□□□ 1.79
UBXN6-208ENST00000592358 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.21■■□□□ 1.79
UBXN6-208ENST00000592358 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.19■■□□□ 1.782e-11■■■■□ 21.3
UBXN6-208ENST00000592358 FBLN2P98095 1184 aa26.17■■□□□ 1.78
UBXN6-208ENST00000592358 WDR97A6NE52 1622 aa26.16■■□□□ 1.78
UBXN6-208ENST00000592358 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.15■■□□□ 1.78
UBXN6-208ENST00000592358 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.14■■□□□ 1.78
UBXN6-208ENST00000592358 TOP2BQ02880 1626 aa26.14■■□□□ 1.77
UBXN6-208ENST00000592358 SYNJ1O43426 1573 aa26.13■■□□□ 1.77
UBXN6-208ENST00000592358 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
UBXN6-208ENST00000592358 ARHGEF11O15085 1522 aa26.12■■□□□ 1.77
UBXN6-208ENST00000592358 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.04■■□□□ 1.76
UBXN6-208ENST00000592358 CHD1O14646 1710 aa26.02■■□□□ 1.76
UBXN6-208ENST00000592358 GRIN2BQ13224 1484 aa26■■□□□ 1.75
UBXN6-208ENST00000592358 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26■■□□□ 1.75
UBXN6-208ENST00000592358 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.99■■□□□ 1.75
UBXN6-208ENST00000592358 PBRM1Q86U86 1689 aa25.98■■□□□ 1.75
UBXN6-208ENST00000592358 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.98■■□□□ 1.75
UBXN6-208ENST00000592358 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
UBXN6-208ENST00000592358 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
UBXN6-208ENST00000592358 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
UBXN6-208ENST00000592358 SYNJ2O15056 1496 aa25.85■■□□□ 1.73
UBXN6-208ENST00000592358 ARAP1Q96P48 1450 aa25.85■■□□□ 1.73
UBXN6-208ENST00000592358 EEA1Q15075 1411 aa25.8■■□□□ 1.72
UBXN6-208ENST00000592358 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
UBXN6-208ENST00000592358 ADAMTS12P58397 1594 aa25.77■■□□□ 1.72
UBXN6-208ENST00000592358 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.74■■□□□ 1.71
UBXN6-208ENST00000592358 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.69■■□□□ 1.7
UBXN6-208ENST00000592358 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.67■■□□□ 1.7
UBXN6-208ENST00000592358 GRIN2AQ12879 1464 aa25.66■■□□□ 1.7
UBXN6-208ENST00000592358 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.64■■□□□ 1.7
UBXN6-208ENST00000592358 KIF27Q86VH2 1401 aa25.63■■□□□ 1.69
UBXN6-208ENST00000592358 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.59■■□□□ 1.69
UBXN6-208ENST00000592358 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.57■■□□□ 1.68
UBXN6-208ENST00000592358 CEP170Q5SW79 1584 aa25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms