RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592515.1

UBXN6-209, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN6, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-209ENST00000592515 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.17■■■□□ 2.58
UBXN6-209ENST00000592515 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.76■■■□□ 2.03
UBXN6-209ENST00000592515 ABCC9O60706 1549 aa27.43■■□□□ 1.98
UBXN6-209ENST00000592515 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.24■■□□□ 1.79
UBXN6-209ENST00000592515 NACADO15069 1562 aa26.17■■□□□ 1.78
UBXN6-209ENST00000592515 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.13■■□□□ 1.77
UBXN6-209ENST00000592515 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.95■■□□□ 1.74
UBXN6-209ENST00000592515 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
UBXN6-209ENST00000592515 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.77■■□□□ 1.72
UBXN6-209ENST00000592515 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.61■■□□□ 1.69
UBXN6-209ENST00000592515 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
UBXN6-209ENST00000592515 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.49■■□□□ 1.67
UBXN6-209ENST00000592515 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.4■■□□□ 1.66
UBXN6-209ENST00000592515 SCRIBQ14160 1630 aa25.34■■□□□ 1.65
UBXN6-209ENST00000592515 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.18■■□□□ 1.62
UBXN6-209ENST00000592515 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
UBXN6-209ENST00000592515 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.77■■□□□ 1.56
UBXN6-209ENST00000592515 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.66■■□□□ 1.54
UBXN6-209ENST00000592515 SMARCA4P51532 1647 aa24.21■■□□□ 1.47
UBXN6-209ENST00000592515 NCAPD3P42695 1498 aa24.18■■□□□ 1.46
UBXN6-209ENST00000592515 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.16■■□□□ 1.46
UBXN6-209ENST00000592515 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
UBXN6-209ENST00000592515 SMARCA2P51531 1590 aa24.09■■□□□ 1.45
UBXN6-209ENST00000592515 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.03■■□□□ 1.44
UBXN6-209ENST00000592515 HMGXB3Q12766 1538 aa24.02■■□□□ 1.44
UBXN6-209ENST00000592515 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.99■■□□□ 1.43
UBXN6-209ENST00000592515 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
UBXN6-209ENST00000592515 WIZO95785 1651 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN6-209ENST00000592515 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
UBXN6-209ENST00000592515 NESP48681 1621 aa23.67■■□□□ 1.38
UBXN6-209ENST00000592515 ERCC6Q03468 1493 aa23.64■■□□□ 1.38
UBXN6-209ENST00000592515 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.54■■□□□ 1.36
UBXN6-209ENST00000592515 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
UBXN6-209ENST00000592515 CUX2O14529 1486 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN6-209ENST00000592515 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN6-209ENST00000592515 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.41■■□□□ 1.34
UBXN6-209ENST00000592515 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-209ENST00000592515 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.34■■□□□ 1.33
UBXN6-209ENST00000592515 CFTRP13569 1480 aa23.28■■□□□ 1.32
UBXN6-209ENST00000592515 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.22■■□□□ 1.31
UBXN6-209ENST00000592515 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN6-209ENST00000592515 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.19■■□□□ 1.3
UBXN6-209ENST00000592515 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.17■■□□□ 1.3
UBXN6-209ENST00000592515 WDR62O43379 1518 aa23.13■■□□□ 1.29
UBXN6-209ENST00000592515 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.02■■□□□ 1.28
UBXN6-209ENST00000592515 PRDM2Q13029 1718 aa22.99■■□□□ 1.27
UBXN6-209ENST00000592515 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
UBXN6-209ENST00000592515 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
UBXN6-209ENST00000592515 TOPBP1Q92547 1522 aa22.79■■□□□ 1.24
UBXN6-209ENST00000592515 ABCC8Q09428 1581 aa22.75■■□□□ 1.23
UBXN6-209ENST00000592515 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.73■■□□□ 1.23
UBXN6-209ENST00000592515 IFT140Q96RY7 1462 aa22.7■■□□□ 1.22
UBXN6-209ENST00000592515 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
UBXN6-209ENST00000592515 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
UBXN6-209ENST00000592515 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
UBXN6-209ENST00000592515 CUX1P39880 1505 aa22.55■■□□□ 1.2
UBXN6-209ENST00000592515 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
UBXN6-209ENST00000592515 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.51■■□□□ 1.19
UBXN6-209ENST00000592515 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.5■■□□□ 1.19
UBXN6-209ENST00000592515 SOGA1O94964 1423 aa22.49■■□□□ 1.19
UBXN6-209ENST00000592515 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.198e-8■■■■■ 39.4
UBXN6-209ENST00000592515 OSCARQ8IYS5 282 aa22.46■■□□□ 1.19
UBXN6-209ENST00000592515 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
UBXN6-209ENST00000592515 WDR97A6NE52 1622 aa22.33■■□□□ 1.17
UBXN6-209ENST00000592515 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.32■■□□□ 1.16
UBXN6-209ENST00000592515 SYNJ1O43426 1573 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-209ENST00000592515 TOP2BQ02880 1626 aa22.28■■□□□ 1.16
UBXN6-209ENST00000592515 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.27■■□□□ 1.16
UBXN6-209ENST00000592515 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-209ENST00000592515 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.26■■□□□ 1.15
UBXN6-209ENST00000592515 GRIN2BQ13224 1484 aa22.25■■□□□ 1.15
UBXN6-209ENST00000592515 FBLN2P98095 1184 aa22.24■■□□□ 1.15
UBXN6-209ENST00000592515 CHD1O14646 1710 aa22.23■■□□□ 1.15
UBXN6-209ENST00000592515 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.22■■□□□ 1.15
UBXN6-209ENST00000592515 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UBXN6-209ENST00000592515 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.19■■□□□ 1.14
UBXN6-209ENST00000592515 TRIM41Q8WV44 630 aa22.17■■□□□ 1.14
UBXN6-209ENST00000592515 PBRM1Q86U86 1689 aa22.14■■□□□ 1.14
UBXN6-209ENST00000592515 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UBXN6-209ENST00000592515 SYNJ2O15056 1496 aa22.13■■□□□ 1.13
UBXN6-209ENST00000592515 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-209ENST00000592515 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-209ENST00000592515 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-209ENST00000592515 ARHGEF11O15085 1522 aa22.11■■□□□ 1.13
UBXN6-209ENST00000592515 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.04■■□□□ 1.12
UBXN6-209ENST00000592515 ADAMTS12P58397 1594 aa21.99■■□□□ 1.11
UBXN6-209ENST00000592515 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.99■■□□□ 1.11
UBXN6-209ENST00000592515 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.97■■□□□ 1.11
UBXN6-209ENST00000592515 GRIN2AQ12879 1464 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN6-209ENST00000592515 ARAP1Q96P48 1450 aa21.92■■□□□ 1.1
UBXN6-209ENST00000592515 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.92■■□□□ 1.1
UBXN6-209ENST00000592515 NUP160Q12769 1436 aa21.89■■□□□ 1.09
UBXN6-209ENST00000592515 KIF27Q86VH2 1401 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN6-209ENST00000592515 CEP170Q5SW79 1584 aa21.87■■□□□ 1.09
UBXN6-209ENST00000592515 IGF1RP08069 1367 aa21.83■■□□□ 1.08
UBXN6-209ENST00000592515 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.74■■□□□ 1.07
UBXN6-209ENST00000592515 CUL7Q14999 1698 aa21.72■■□□□ 1.07
UBXN6-209ENST00000592515 SHROOM2Q13796 1616 aa21.72■■□□□ 1.07
UBXN6-209ENST00000592515 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.68■■□□□ 1.06
UBXN6-209ENST00000592515 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.68■■□□□ 1.06
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