Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBH1

PDF, Peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDFQ9HBH1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDFQ9HBH1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDFQ9HBH1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDFQ9HBH1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms