Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

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Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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LGI3Q8N145 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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LGI3Q8N145 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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LGI3Q8N145 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LGI3Q8N145 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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LGI3Q8N145 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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LGI3Q8N145 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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LGI3Q8N145 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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LGI3Q8N145 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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LGI3Q8N145 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LGI3Q8N145 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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