Protein–RNA interactions for Protein: Q12815

TROAP, Tastin, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAPQ12815 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TROAPQ12815 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TROAPQ12815 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TROAPQ12815 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
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